Diplômé de l'Université de Lausanne, Ermindo Di Paolo travaille depuis 1990 en tant que pharmacien dans le Service de Pharmacie du CHUV à Lausanne, d'abord dans l'unité de Production, puis dans celle d'Assistance pharmaceutique. Après avoir réalisé son doctorat de 1996 à 2000, il obtient le titre de pharmacien d'hôpital FPH l'année suivante et est nommé responsable de l'assistance pharmaceutique du Département médico-chirurgical de Pédiatrie au CHUV et à l'Hôpital de l'Enfance. Dans le cadre de son activité, il participe notamment à des projets de recherche en pharmacothérapie pédiatrique, est répondant qualité de l'unité Assistance pharmaceutique (diplôme de répondant qualité en milieu hospitalier), membre consultatif de la Commission permanente des médicaments et chargé de cours (formateur FPH pour la formation post-graduée en pharmacie hospitalière et obtention du certificat FPH de formation complémentaire en pharmacie clinique et du titre de formateur FPH pour la formation post-graduée en pharmacie clinique). Enfin, il est l'auteur de nombreuses publications.